Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms