Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms