Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6P435 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6P435 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms