Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms