Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms