Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCSD1Q6JBY9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms