Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms