Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf57Q5W0N0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf57Q5W0N0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf57Q5W0N0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf57Q5W0N0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf57Q5W0N0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf57Q5W0N0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf57Q5W0N0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf57Q5W0N0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf57Q5W0N0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf57Q5W0N0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms