Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AGAP9Q5VTM2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AGAP9Q5VTM2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms