Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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COL5A1-AS1Q5SY13 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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COL5A1-AS1Q5SY13 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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COL5A1-AS1Q5SY13 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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COL5A1-AS1Q5SY13 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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COL5A1-AS1Q5SY13 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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COL5A1-AS1Q5SY13 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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