Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms