Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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