Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267 ms