Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms