Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MICAQ29983 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MICAQ29983 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MICAQ29983 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MICAQ29983 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MICAQ29983 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MICAQ29983 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms