Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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