Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms