Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PDK4Q16654 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PDK4Q16654 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PDK4Q16654 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PDK4Q16654 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PDK4Q16654 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PDK4Q16654 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PDK4Q16654 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PDK4Q16654 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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