Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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