Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms