Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP7Q16576 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms