Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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