Protein–RNA interactions for Protein: Q15654

TRIP6, Thyroid receptor-interacting protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP6Q15654 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP6Q15654 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP6Q15654 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms