Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms