Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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