Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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