Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAPQ14761 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms