Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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