Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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GBX1Q14549 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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GBX1Q14549 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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GBX1Q14549 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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