Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms