Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CNGB1Q14028 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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