Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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