Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOFQ13790 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOFQ13790 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOFQ13790 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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