Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAPSNQ13702 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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