Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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