Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNW1Q13573 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms