Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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