Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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