Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB2Q13425 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms