Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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