Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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