Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms