Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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