Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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NFX1Q12986 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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NFX1Q12986 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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NFX1Q12986 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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NFX1Q12986 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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NFX1Q12986 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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NFX1Q12986 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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NFX1Q12986 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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NFX1Q12986 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFX1Q12986 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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