Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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