Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms