Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms