Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms