Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms