Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FMODQ06828 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms